Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BFSP2Q13515 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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