Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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