Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms