Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP140Q13342 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP140Q13342 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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