Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms