Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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PRDM2Q13029 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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PRDM2Q13029 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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PRDM2Q13029 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
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PRDM2Q13029 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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