Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms