Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 421.49■■□□□ 1.037e-6■■□□□ 11.5
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ILF3Q12906 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-8■■□□□ 11.5
ILF3Q12906 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-8■■□□□ 11.5
ILF3Q12906 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 11.5
ILF3Q12906 YWHAE-202ENST00000466227 1377 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-9■■□□□ 11.5
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ILF3Q12906 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 IST1-213ENST00000538565 1245 ntTSL 210.91□□□□□ -0.661e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.761e-6■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 IST1-212ENST00000538104 531 ntTSL 48.68□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.091e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 IST1-217ENST00000540296 476 ntTSL 47.09□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.82e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.751e-7■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 GUSB-203ENST00000430730 1859 ntTSL 523.74■■□□□ 1.391e-7■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 GUSB-204ENST00000446111 933 ntTSL 1 (best)23.39■■□□□ 1.331e-7■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-7■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 CCNI-208ENST00000515468 636 ntTSL 35.14□□□□□ -1.592e-12■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 53.84□□□□□ -1.795e-12■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.485e-7■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.46e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 YJEFN3-202ENST00000458210 2785 ntTSL 215.42■□□□□ 0.066e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-201ENST00000334841 724 ntTSL 314.84□□□□□ -0.036e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.126e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.186e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 11.4
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ILF3Q12906 DEAF1-211ENST00000529727 248 ntTSL 37.35□□□□□ -1.236e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 STAT5B-204ENST00000468496 897 ntTSL 56.32□□□□□ -1.46e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 STAT5B-205ENST00000481253 491 ntTSL 25.73□□□□□ -1.496e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-207ENST00000468330 551 ntTSL 44.64□□□□□ -1.676e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-202ENST00000396610 593 ntTSL 24.07□□□□□ -1.766e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-206ENST00000467644 549 ntTSL 33.61□□□□□ -1.836e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-203ENST00000418849 484 ntTSL 33.29□□□□□ -1.886e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 CMC1-211ENST00000495428 608 ntTSL 33.26□□□□□ -1.896e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.26e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.446e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.586e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-202ENST00000572415 796 ntTSL 24.89□□□□□ -1.636e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.646e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-203ENST00000573087 851 ntTSL 34.61□□□□□ -1.676e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.846e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.96e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 FOPNL-209ENST00000575938 381 ntTSL 33.07□□□□□ -1.926e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 322.87■■□□□ 1.251e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.141e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.891e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 215.18■□□□□ 0.021e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 212.55□□□□□ -0.41e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-9■■□□□ 11.4
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