Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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