Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms