Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms