Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLEQ07864 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms