Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOX4Q06945 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOX4Q06945 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms