Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms