Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms