Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms