Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms