Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms