Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRCDQ00LT1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms