Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms