Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms