Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELF3P78545 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELF3P78545 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELF3P78545 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms