Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms