Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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