Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM3BP58499 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM3BP58499 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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