Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB25P57735 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB25P57735 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms