Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF3P57682 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms