Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A3P48764 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A3P48764 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A3P48764 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A3P48764 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A3P48764 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC9A3P48764 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms