Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD8P48556 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms