Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTRNP46939 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTRNP46939 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTRNP46939 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTRNP46939 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTRNP46939 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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