Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms