Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms