Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC1P41238 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms