Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms