Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRHRP34981 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRHRP34981 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRHRP34981 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRHRP34981 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRHRP34981 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRHRP34981 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRHRP34981 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRHRP34981 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms