Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms