Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL365214.1-201ENST00000404237 997 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AP001171.1-201ENST00000436373 864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LINC01548-201ENST00000451980 696 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC051619.5-203ENST00000561404 529 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AL356259.1-201ENST00000443554 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 SGO1-210ENST00000443724 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC013400.1-201ENST00000607190 545 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms