Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID4AP29374 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms