Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD34P28906 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD34P28906 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD34P28906 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD34P28906 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms