Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHATP28329 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHATP28329 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms