Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXP28300 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXP28300 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXP28300 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms