Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CADP27708 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CADP27708 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CADP27708 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CADP27708 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CADP27708 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms