Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMLP26374 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMLP26374 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms