Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTX3P26022 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTX3P26022 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms