Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LMO1P25800 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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LMO1P25800 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LMO1P25800 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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