Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1P21675 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms