Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK11BP21127 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms