Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNF1AP20823 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HNF1AP20823 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HNF1AP20823 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HNF1AP20823 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HNF1AP20823 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HNF1AP20823 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms