Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms