Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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